הירקות בחממת החקר, גדלים בתנאים מבוקרים כגון: טמפרטורה, קירוי, הגנה מרוח, טיב הקרקע. התלמידים חוקרים, בודקים, שואלים שאלות ומתנסים בפעילות חקר הלכה למעשה.
באמצעות התנסות חווייתית ומעשית, המשלבת יישום של דרכי חקר שונות, התלמידים רוכשים רקע מדעי וחקלאי, לומדים על חלקי הצמח השונים, ותנאי הגידול הנדרשים על מנת לגדל ירקות.
בחממת החקר התלמידים מתכננים ועורכים ניסויים שונים. בוחנים מגוון תנאי גידול, השפעות על קצב הגדילה של הצמח, שימושים בחומרי הדברה שונים, גידול על סוגי מצע שונים, ועוד.
בתהליך החקר בודקים את השפעת גורם המשפיע על גורם המושפע ממנו. מעלים השערות, עורכים ניסוי, אוספים תוצאות, מאששים או מפריכים השערה ומסיקים מסקנות.